Základní pojmy
Slovníček pojmů
Vážení návštěvníci. Od konce srpna 2011 jsou tyto stránky přesunuty na novou adresu - http://www.genetika-biologie.cz/. Veškeré texty a materiály naleznete nyní na nové doméně. Tyto stránky - genetika.wz.cz - zůstanou nadále funkční, ale nebudou již dále rozšiřovány, opravovány a doplňovány; veškeré novinky a úpravy budou již jen na nových stránkách Genetika - Biologie. Doufám, že se Vám budou líbit ;-)
A
B |
C |
D |
E |
F |
G |
H |
CH |
I |
K |
L |
M |
N |
O |
P |
R |
S |
T |
U |
V |
Z|
A
- Adenin
- 6-aminopurin; purinová báze, přítomná v DNA i RNA
- AIDS
- Acquired immunodeficiency syndrome - syndrom získané imunodeficience, způsobený virem HIV (Human immunodeficiency virus)
- Alela
- Konkrétní forma genu, vyskytující se ve specifickém lokusu
- AMC
- viz Amniocentéza
- Amniocentéza
- Invazivní zákrok využívaný k získání plodové vody a buněk k cytogenetickému vyšetření plodu
- Anafáze
- Fáze buněčného dělení, při které dochází k rozestupu chromosomů k pólům buňky
- Apoptóza
- Programovaná buněčná smrt; na rozdíl od nekrózy nepoškozuje okolní buňky
- Arabidopsis thaliana
- Huseníček rolní - rostlina z čeledi brukvovitých; modelový organismus genetického výzkumu
- Autosomy
- Somatické chromosomy - všechny chromosomy mimo chromosomy pohlavní
B
- B generace
- Generace zpětného křížení (backcross) - mezi jedincem F generace a P generace
- Bakteriofág
- Virus napadající bakterie
- Barrovo tělísko
- Optickým mikroskopem pozorovatelná "hrudka" chromatinu, která představuje inaktivovaný X chromosom (vyskytuje se u jedinců s více než jedním X chromosomem - běžně tedy u žen)
- Bivalent
- Sdružený pár homologních zdvojených chromosomů pozorovatelný během meiotické profáze; někdy též nazývaný tetráda
C
- cDNA
- Complementary DNA - DNA vzniklá zpětným přepisem z RNA do DNA; využívaná v cDNA knihovnách
- Caenorhabdis elegans
- Malá hlístice sloužící jako modelový organismus genetického výzkumu
- Centromera
- Místo primárního zaškrcení chromosomu, odděluje krátké a dlouhé raménko
- Crossing-over
- Proces rekombinace mezi homologními chromosomy během profáze meiotického dělení
- CVS
- Chorionic villus sampling - viz odběr choriových klků
- Cytosin
- 2-oxo-4-aminopyrimidin; pyrimidinová báze, přítomná v DNA i RNA
D
- Denaturace
- Proces, při kterém se dvoušroubovice DNA (vlivem teploty nebo iontů solí) rozpojí na jednotlivá vlákna (zrušení vodíkových můstků)
- DGGE
- Denaturing gradient gel electrophoresis - jedna z metod přímé DNA diagnostiky, využívající elektroforézu na gelu s denaturačním činidlem
- Dihydrouridin
- Jedna z minoritních bazí, přítomná v D kličce tRNA
- Diktyotene
- Stádium klidu nedokončené meiotické profáze, ve kterém se lidský oocyt nachází až do případné ovulace
- Diplotene
- 4. fáze profáze I. meiotického dělení
- Disjunkce
- Proces rozchodu chromosomů k opačným pólům buňky během buněčného dělení
- Disrupce
- Porucha prenatálního vývoje, způsobená negativním mechanickým vlivem vnějšího prostředí na normálně se vyvíjející orgán
- DNA
- Kyselina deoxyribonukleová
- Drosophila melanogaster
- Octomilka - malá muška sloužící jako modelový organismus genetického výzkumu
- Dysplasie
- Porucha prenatálního vývoje jedince, způsobená abnormálním uspořádáváním buněk ve vyvíjejícím se orgánu
E
- Enzymy
- Biokatalyzátory - je jim věnována kapitola Enzymy
- Eufenika
- Zlepšování fenotypu postižených jedinců
- Eugenika
- Zlepšování genofondu populace snižováním frekvence nežádoucích alel
- Euchromatin
- Dekondenzovaný chromatin (je zde transkripční aktivita), jevící se světle v optickém mikroskopu
- Exon
- Oblast genu přepisovaná do RNA, která obsahuje sekvence skutečně kódující proteiny
F
- F1 generace
- Filiální generace - vzniká křížením P generací; křížením F1 jedinců vznikají F2 jedinci atd.
- Fenotyp
- Soubor všech dědičných znaků jedince; více či méně pozorovatelný projev genotypu
- Fetus
- Plod; u člověka je jako plod označován vyvíjející se jedinec starší 3 měsíců
- FISH
- Fluorescent in situ hybridization - fluorescenční in situ hybridizace - metoda přímé detekce specifického úseku genomu pomocí fluorescenčně značené sondy
G
- Gameta
- Pohlavní buňka s haploidní sadou chromosomů; splynutím samčí a samičí gamety vzniká zygota
- Gen
- Specificky umístěná jednotka dědičné informace, kódující sekvenci pro tvorbu proteinového produktu
- Genofond
- Soubor všech genů v populaci určitého druhu
- Genom
- Soubor veškeré dědičné informace buňky nebo jedince
- Genomika
- Oblast genetiky, zabývající se genomem určitého organismu; úkolem bývá sekvenovat genom organismu a využívat tyto informace v dalších oblastech genomiky (proteomika, farmakogenomika, nutrigenomika...)
- Genotyp
- Genetická výbava jedince; podmiňuje fenotyp
- Gonosomy
- Pohlavní chromosomy; nejsou homologní; jejich kombinace v buňce podmiňuje pohlaví jedince
- Guanin
- 2-amino-6-oxopurin; purinová báze, přítomná v DNA i RNA
H
- HA
- Heteroduplex analysis - heteroduplexová analýza; metoda přímé DNA diagnostiky, založená na tvorbě heteroduplexů mutovaného a nemutovaného vlákna
- Haplotyp
- Skupina alel na jednom chromosomu, které jsou děděny spolu (nedochází mezi nimi k rekombinaci)
- Hemizygot
- Jedinec pouze s jednou alelou sledovaného genu; typické pro muže vzhledem ke genům umístěným na X chromosomu
- Heterochromatin
- Kondenzovaný chromatin (neprobíhá zde transkripce), jevící se tmavě v optickém mikroskopu
- Heterozygot
- Jedinec, jehož alely sledovaného genu jsou navzájem různé
- Histony
- Bazické proteiny, spoluvytvářející stavbu chromatinu a celých eukaryotických chromosomů
- HLP
- Histon like proteins - histonům podobné proteiny - prokaryotické proteiny, které zastávají u prokaryot podobnou funkci jako histony u eukaryot
- Homeoboxové geny
- Geny s vysoce konzervovanou doménou (homeodoménou), která se relativně nezměněná vyskytuje u většiny organismů; HOX geny jsou významné morfogeny, určující ontogenetický vývoj jedince
- Homozygot
- Jedinec, jehož alely sledovaného genu jsou stejné
- HUGO
- Human Genome Organisation - organizace pro mapování lidského genomu - http://www.hugo-international.org/
- Hybridizace
- Proces spojování dvou komplementárních vláken DNA podle pravidel o párování bází; takto může například hybridizovat specifická sonda s vyšetřovaným vláknem DNA
Ch
- Chiasmata
- Překřížení, viditelná během meiotické profáze v místech, kde došlo ke crossing-overu
- Chloroplast
- Semiautonomní organela rostlin, schopná fotosyntézy; obsahuje vlastní genetickou informaci
- Chromosom
- Pentlicovitý útvar tvořený DNA a bílkovinami, nejlépe viditelný v kondenzovaném stavu během mitózy nebo meiózy eukaryotických buněk
I
- Inbreeding
- Křížení příbuzných jedinců
- Imprinting
- Specifické označování určitých sekvencí DNA pomocí methylace bází; díky tomuto fenoménu lze odlišovat, zda je takto označený chromosom mateřského nebo otcovského původu
- Inosin
- Nukleotid, obsahující deaminovaný adenin - hypoxanthin (6-oxypurin); vyskytuje se v menším množství v tRNA
- Intron
- Oblast genu přepisovaná do RNA, která neobsahuje sekvence skutečně kódující proteiny; je vyštěpena během posttranskripčních úprav u eukaryot
- ISH
- In situ hybridization - in situ hybridizace; metoda detekce specifické sekvence pomocí značené sondy in situ (třeba na podložním sklíčku)
- IVF
- In vitro fertilization - oplodnění ve zkumavce
K
- Kancerogen
- Látka schopná vyvolat nádorové bujení
- Karyotyp
- Chromosomální výbava buňky nebo jedince
- Kinetochora
- Úsek na centromeře, do kterého se upínají mikrotubuly dělícího vřeténka během mitózy či meiózy
- Kolchicin
- Původem rostlinný alkaloid, používaný v cytogenetice jako "vřeténkový jed", schopný zadržet buňku v metafázi mitotického dělení (za účelem snadnějšího pozorování chromosomů)
L
- Leptotene
- 1. fáze profáze I. meiotického dělení
- Lokus
- Místo (pozice) určitého genu na chromosomu
M
- Malformace
- Porucha prenatálního vývoje jedince, postihující zpravidla pouze jeden orgán; bývá podmíněna geneticky
- Meióza
- Redukční dělení (ve skutečnosti pouze I. meiotické dělení je redukční; II. meiotické dělení je stejně jako mitóza dělení ekvační); díky němu vznikají haploidní buňky (gamety)
- Metafáze
- Fáze buněčného dělení, během které se chromosomy staví do středové (ekvatoriální) roviny
- Mitochondrie
- Semiautonomní organela eukaryotických buněk; obsahuje vlastní genetickou informaci a slouží jako energetické centrum buňky
- Mitóza
- Ekvační dělení; vznikají jím buňky se shodnou chromosomální výbavou (diploidní)
- mRNA
- Messenger RNA - mediátorová RNA; slouží jako matrice pro proteosyntézu
- mtDNA
- Mitochondriální DNA - genetická informace, uchovávaná v kruhové molekule DNA mitochondrií
- Mus musculus
- Myš domácí - modelový organismus využívaný v genetickém výzkumu
- Mutace
- Změna v sekvenci DNA; pokud neznemožňuje rozmnožování jedince, pak je dědičná
- Mutagen
- Faktor vnějšího prostředí, schopný zapříčinit mutace v genetické informaci organismu
N
- Nekróza
- Neprogramovaná buněčná smrt, způsobená virovou nebo bakteriální infekcí, nebo jinými nepříznivými vnějšími vlivy; enzymy z rozpadlé buňky mohou poškozovat buňky okolní
- Nondisjunkce
- Proces chybného rozestupu chromosmů při mitóze nebo meióze
- Nukleoid
- Jaderný ekvivalent - prokaryotické "jádro" tvořené především jedinou cirkulární molekulou DNA
- Nukleolus
- Jadérko je součást eukaryotického jádra, tvořená především RNA a proteiny, odpovědná za syntézu ribozomální RNA
- Nukleosom
- Základní struktura chromatinu, tvořená osmi histony, obtočenými DNA o délce 143 párů bází
- Nukleus
- Jádro; buněčná organela obsahující naprostou většinu buněčné genetické informace
O
- Odběr choriových klků
- Invazivní metoda sloužící k získání buněk s genetickou informací plodu z choriových klků. Je zatížena vyšším rizikem než amniocentéza, ale buňky se rychleji kultivují.
- Onkogeny
- Geny, jejichž mutace způsobí neřízené dělení buňky a stává se tak základem pro nádorové bujení; jediná funkční kopie onkogenu nestačí udržet buněčnou regulaci v normálu
- Oocyt
- Vajíčko; ženská gameta
- Operon
- Prokaryotická transkripční jednotka, kódující více proteinů najednou
P
- P generace
- Parentální generace - rodičovská generace
- Pachytene
- 3. fáze profáze I. meiotického dělení
- PCR
- Polymerase chain reaction - polymerázová řetězová reakce; cyklická reakce, která umožňuje mnohonásobné namnožení požadovaného úseku DNA
- PKU
- Fenylketonurie - dědičná metabolická choroba způsobená deficiencí enzymu fenylalaninhydroxylasy
- Polymorfismus
- Pokud se v daném lokusu mohou v populaci vyskytovat minimálně dvě různé alely, z nichž vzácnější alela se objevuje alespoň v 1% případů, potom je tento gen polymorfní
- pre-mRNA
- Primární eukaryotická mRNA, která ještě neprošla postranskripčními úpravami
- Profáze
- První fáze buněčného dělení (u meiotického dělení se ještě rozděluje na další fáze), při které se chromosomy kondenzují a spiralizují
- Prometafáze
- Přechod buněčného dělení z profáze do metafáze, charakterizovaný rozpadem jaderného obalu
- Promotor
- Signální sekvence v DNA, která je důležitá pro nasednutí příslušné RNA-polymerasy a tím pádem pro rozeznání začátku transkripce
- Proband
- Jedinec, na jehož žádost je sestavováno genealogické schéma
- Pseudouridin
- Minoritní báze, přítomná v ψ kličce tRNA
R
- Rattus norvegicus
- Potkan - modelový organismus sloužící v genetickém výzkumu
- Renaturace
- Opětovná asociace denaturovaných vláken dvoušroubovice DNA (opětovná tvorba vodíkových můstků mezi vzájemně komplementárními úseky)
- Retrovirus
- Skupina RNA virů, schopné pomocí reverzní transkriptázy přepsat svou genetickou informaci do DNA, kterou následně mohou inzertovat do genomu hostitelské buňky
- RFLP
- Restriction fragment length polymorphism - polymorfismus délky restrikčních fragmentů; existence různě dlouhých fragmentů po štěpení DNA restrikční endonukleasou u různých osob; využitelné v nepřímé DNA diagnostice
- Ribozom
- Nemembránová organela, složená z větší a menší podjednotky, na které probíhá podle matrice mRNA proteosyntéza
- RNA
- Kyselina ribonukleová; nositelka dědičné informace u některých virů; u vyšších živočichů se podílí na realizaci genetické informace; bylo prokázáno, že má autokatalytickou funkci
- rRNA
- Ribozomální RNA; tvoří spolu s proteiny vlastní hmotu ribozomu
S
- SCID
- Severe combined immunodeficiency - těžká kombinovaná imunodeficience; deficit T- i B-lymfocytů
- Sex chromatin
- viz Barrovo tělísko
- Složený heterozygot
- Tímto termínem označujeme jedince, který nemá ani jednu zdravou (nemutovanou) alelu, jeho 2 mutované alely však nejsou shodné
- SNP
- Single nucleotide polymorphism - polymorfismus jediného nukleotidu; jde o nejčastější formu polymorfismu v lidském genomu, vyskytující se asi jedenkrát na 1000 bází
- snRNA
- Small nuclear RNA - malé jaderné RNA; účastní se sestřihu pre-mRNA
- Spermie
- Mužská gameta
- SSCP
- Single strand conformation polymorphism - polymorfismus konformace jednovláknových částí DNA; metoda přímé DNA diagnostiky
- Syncytium
- Soubuní - útvar vzniklý splynutím několika buněk; bývá polyploidní
- Syndrom
- Mnohočetné vady s charakteristickým fenotypovým projevem, stejné etiologie
T
- TATA-box
- Jedna z nejčastějších promotorových sekvencí, tvořená charakteristickým uspořádáním adeninů a thyminů
- Telofáze
- Závěrečná fáze buněčného dělení, během níž se znovu tvoří jaderný obal a despiralizují chromosomy
- Telomera
- Koncové sekvence chromosomů; brání fůzi chromosomů
- Teratogen
- Látka (obecně vnější faktor), která je schopná v příslušném období těhotenství u matky s příslušným genotypem navodit příslušnou vrozenou vadu
- Thymin
- 2,4-dioxo-5-methylpyrimidin; pyrimidinová báze, přítomná pouze v DNA
- tRNA
- Transferová RNA; přináší aktivované aminokyseliny na ribozom, kde se z nich podle matrice mRNA tvoří polypeptidové vlákno
- Tumor-supresorové geny
- Geny, které jsou zodpovědné za stabilitu genomu a zabraňují replikaci poškozené DNA; pokud jsou obě kopie tumor-supresorového genu mutovány, buňka se může začít dělit s poškozenou genetickou informací a proměnit se v nádorovou buňku
U
- Uracyl
- 2,4-dioxopyrimidin; pyrimidinová báze, přítomná pouze v RNA
V
- Vazba
- Pokud jsou geny na stejném chromosomu, potom jsou ve vazbě, jejíž síla závisí na vzdálenosti obou genů na chromosomu
- VNTR
- Variable number of tandem repeats - variabilní počet tandemových opakujících se sekvencí; polymorfismy těchto opakujících se sekvencí (různí lidé mají různý počet opakujících se sekvencí) jsou využitelné v DNA diagnostice nebo forenzním lékařství (určování identity)
Z
- Zygota
- Zygota je buňka, vznikající splynutím dvou gamet; gamety jsou haploidní buňky, zygota se tak stává opět buňkou diploidní
- Zygotene
- 2. fáze profáze I. meiotického dělení